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被数据库收录-
除 ISI 数据库的 SCI 网络版（ SCIE ）和 CC （ Current Contents/Agriculture, Biology & Environmental Sciences ）以外，据不完全统计，《植物分类学报》还被以下国际和国内数据库收录 。
AGRICOLA ( 美国农业文献索引）
AGRIS International （国际农业文献索引）
BIOSIS
CABS （ Current Advances in Applied Microbiology & Biotechnology)
Excerpta Botanica （植物学文摘）
Index Filicum （蕨类索引）
Index Kewensis （邱园——英国皇家植物园索引）
Index to Plant Chromosome Numbers （植物染色体数目索引）
PASCAL （法国科学文摘）
Plant Breeding Abstracts （植物育种文摘）
The Kew Record of Taxonomic Literature (Royal Botanic Gardens Kew) （邱园——英国皇家植物园分类学文献录）
World Checklist of Seed Plants （世界种子植物名录）
中国科技论文统计与分析数据库
中国学术期刊综合评价数据库
中国科学文献数据库
中国科学引文数据库
中国期刊数据库
中国林业科技文献数据库
☆中国学术期刊 ( 全文库 )
☆中国期刊网 ( 全文库 )
☆ 万方数据资源系统 ( 全文库 )
☆ 重庆维普